Ultrazvuková extrakcia sa používa hlavne v džúsovom a nápojovom priemysle na extrakciu účinných zložiek, ako sú pektín a rastlinné pigmenty. Ultrazvukové vibrácie môžu preraziť steny rastlinných buniek, čo umožní pektínu, rastlinným pigmentom a ďalším zložkám vytiecť do šťavy. Zároveň ultrazvuk pokračuje v práci na rozptýlení častíc pektínu a rastlinného pigmentu na menšie. Tieto menšie častice môžu byť rovnomernejšie a stabilnejšie rozdelené do šťavy. Stabilita ultrazvukom extrahovaného a rafinovaného pektínu je samozrejme zvýšená. Vstrekovanie do štiav a nápojov môže zabrániť ich usadzovaniu a delaminácii. Farba rastlinných pigmentov extrahovaných a rafinovaných ultrazvukom je živšia, čo môže výrazne zlepšiť farbu džúsov a nápojov.