Ultrazvuková extrakcia sa používa hlavne v priemysle výroby štiav a nápojov na extrakciu účinných zložiek, ako je pektín a rastlinné pigmenty. Ultrazvukové vibrácie môžu preniknúť cez bunkové steny rastlín, čo umožňuje pektínu, rastlinným pigmentom a ďalším zložkám vytekať do šťavy. Zároveň ultrazvuk naďalej rozptyľuje častice pektínu a rastlinného pigmentu na menšie častice. Tieto menšie častice sa môžu rovnomernejšie a stabilnejšie rozložiť v šťave. Stabilita ultrazvukom extrahovaného a rafinovaného pektínu sa evidentne zvyšuje. Jeho vstreknutie do štiav a nápojov môže zabrániť ich usadzovaniu a delaminácii. Farba rastlinných pigmentov extrahovaných a rafinovaných ultrazvukom je živšia, čo môže výrazne zlepšiť farbu štiav a nápojov.